* using log directory 'd:/Rcompile/CRANpkg/local/4.7/spinebil.Rcheck' * using R Under development (unstable) (2026-05-09 r90031 ucrt) * using platform: x86_64-w64-mingw32 * R was compiled by gcc.exe (GCC) 14.3.0 GNU Fortran (GCC) 14.3.0 * running under: Windows Server 2022 x64 (build 20348) * using session charset: UTF-8 * current time: 2026-05-10 19:12:34 UTC * checking for file 'spinebil/DESCRIPTION' ... OK * checking extension type ... Package * this is package 'spinebil' version '1.0.5' * package encoding: UTF-8 * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for hidden files and directories ... OK * checking for portable file names ... OK * checking whether package 'spinebil' can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking 'build' directory ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking for left-over files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking code files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... [1s] OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... [0s] OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... [0s] OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... [0s] OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... [1s] OK * checking loading without being on the library search path ... [1s] OK * checking use of S3 registration ... OK * checking dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... [3s] OK * checking Rd files ... [1s] OK * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking installed files from 'inst/doc' ... OK * checking files in 'vignettes' ... OK * checking examples ... [1s] ERROR Running examples in 'spinebil-Ex.R' failed The error most likely occurred in: > ### Name: compare_smoothing > ### Title: Compare traces with different smoothing options. > ### Aliases: compare_smoothing > > ### ** Examples > > d <- as.matrix(spiral_data(30, 3)) > tPath <- tourr::save_history(d, max_bases=2) > tPath <- as.list(tourr::interpolate(tPath, 0.3)) Error in .subset(x, i, j, k, drop = FALSE) : incorrect number of dimensions Calls: as.list ... as.list.history_array -> do.call -> apply -> array -> [ -> [.history_array Execution halted * checking for unstated dependencies in vignettes ... OK * checking package vignettes ... OK * checking re-building of vignette outputs ... [177s] ERROR Error(s) in re-building vignettes: --- re-building 'more_descriptives.qmd' using html processing file: more_descriptives.qmd Progress: ──────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ─ 100% Progress: ── 100% Progress: ── 100% Progress: ─── 100% Progress: ──── 100% Progress: ───── 100% Progress: ───── 100% Progress: ────── 100% Progress: ─────── 100% Progress: ─────── 100% Progress: ──────── 100% Progress: ───────── 100% Progress: ───────── 100% Progress: ────────── 100% Progress: ────────── 100% Progress: ─────────── 100% Progress: ─────────── 100% Progress: ──────────── 100% Progress: ───────────── 100% Progress: ───────────── 100% Progress: ────────────── 100% Progress: ────────────── 100% Progress: ─────────────── 100% Progress: ──────────────── 100% Progress: ──────────────── 100% Progress: ───────────────── 100% Progress: ───────────────── 100% Progress: ────────────────── 100% Progress: ────────────────── 100% Progress: ─────────────────── 100% Progress: ─────────────────── 100% Progress: ──────────────────── 100% Progress: ──────────────────── 100% Progress: ──────────────────── 100% Progress: ────────────────────── 100% Progress: ────────────────────── 100% Progress: ────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100% Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%output file: more_descriptives.knit.md pandoc to: html output-file: more_descriptives.html standalone: true embed-resources: true wrap: none default-image-extension: png css: - >- D:/RCompile/CRANpkg/lib/4.7/quarto/rmarkdown/template/quarto_vignette/resources/vignette.css variables: {} metadata document-css: false lang: en engines: - path: C:\Program Files\Quarto\share\extension-subtrees\julia-engine\_extensions\julia-engine\julia-engine.js minimal: true theme: none title: Exploring Potential of Functions to be used for Projection Pursuit vignette: | %\VignetteIndexEntry{More Descriptive Analysis of Projection Pursuit Indices} %\VignetteEngine{quarto::html} %\VignetteEncoding{UTF-8} Output created: more_descriptives.html --- finished re-building 'more_descriptives.qmd' --- re-building 'ppi_diagnostics.qmd' using html processing file: ppi_diagnostics.qmd Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions Backtrace: ▆ 1. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath, 0.3)) 2. └─tourr::interpolate(tPath, 0.3) 3. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 4. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 5. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 6. ├─base::as.list(basis_set) 7. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 8. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 9. └─base::apply(x, 3, list) 10. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 11. ├─newX[, i] 12. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) Quitting from ppi_diagnostics.qmd:101-108 [unnamed-chunk-3] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions --- Backtrace: ▆ 1. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath, 0.3)) 2. └─tourr::interpolate(tPath, 0.3) 3. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 4. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 5. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 6. ├─base::as.list(basis_set) 7. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 8. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 9. └─base::apply(x, 3, list) 10. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 11. ├─newX[, i] 12. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Execution halted WARN: Error encountered when rendering files Error: processing vignette 'ppi_diagnostics.qmd' failed with diagnostics: ! Error running quarto CLI from R. Caused by error in `quarto_render()`: ✖ Error returned by quarto CLI. ----------------------------- processing file: ppi_diagnostics.qmd Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions Backtrace: ▆ 1. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath, 0.3)) 2. └─tourr::interpolate(tPath, 0.3) 3. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 4. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 5. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 6. ├─base::as.list(basis_set) 7. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 8. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 9. └─base::apply(x, 3, list) 10. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 11. ├─newX[, i] 12. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) Quitting from ppi_diagnostics.qmd:101-108 [unnamed-chunk-3] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions --- Backtrace: ▆ 1. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath, 0.3)) 2. └─tourr::interpolate(tPath, 0.3) 3. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 4. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 5. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 6. ├─base::as.list(basis_set) 7. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 8. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 9. └─base::apply(x, 3, list) 10. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 11. ├─newX[, i] 12. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Execution halted WARN: Error encountered when rendering files Caused by error in `processx::run()`: ! System command 'quarto.exe' failed --- failed re-building 'ppi_diagnostics.qmd' --- re-building 'spinebil.qmd' using html processing file: spinebil.qmd Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions Backtrace: ▆ 1. └─spinebil::get_trace(d, m, index_list, index_labels) 2. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath)) 3. └─tourr::interpolate(tPath) 4. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 5. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 6. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 7. ├─base::as.list(basis_set) 8. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 9. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 10. └─base::apply(x, 3, list) 11. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 12. ├─newX[, i] 13. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) Quitting from spinebil.qmd:43-57 [example] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions --- Backtrace: ▆ 1. └─spinebil::get_trace(d, m, index_list, index_labels) 2. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath)) 3. └─tourr::interpolate(tPath) 4. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 5. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 6. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 7. ├─base::as.list(basis_set) 8. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 9. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 10. └─base::apply(x, 3, list) 11. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 12. ├─newX[, i] 13. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Execution halted WARN: Error encountered when rendering files Error: processing vignette 'spinebil.qmd' failed with diagnostics: ! Error running quarto CLI from R. Caused by error in `quarto_render()`: ✖ Error returned by quarto CLI. ----------------------------- processing file: spinebil.qmd Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions Backtrace: ▆ 1. └─spinebil::get_trace(d, m, index_list, index_labels) 2. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath)) 3. └─tourr::interpolate(tPath) 4. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 5. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 6. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 7. ├─base::as.list(basis_set) 8. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 9. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 10. └─base::apply(x, 3, list) 11. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 12. ├─newX[, i] 13. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) Quitting from spinebil.qmd:43-57 [example] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `.subset()`: ! incorrect number of dimensions --- Backtrace: ▆ 1. └─spinebil::get_trace(d, m, index_list, index_labels) 2. ├─base::as.list(tourr::interpolate(tPath)) 3. └─tourr::interpolate(tPath) 4. ├─tourr::new_tour(basis_set[, , 1], planned_tour(basis_set, cycle)) 5. │ └─base::stopifnot(inherits(tour_path, "tour_path")) 6. └─tourr::planned_tour(basis_set, cycle) 7. ├─base::as.list(basis_set) 8. └─tourr:::as.list.history_array(basis_set) 9. ├─base::do.call("c", apply(x, 3, list)) 10. └─base::apply(x, 3, list) 11. ├─base::array(newX[, i], d.call, dn.call) 12. ├─newX[, i] 13. └─tourr:::`[.history_array`(newX, , i) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Execution halted WARN: Error encountered when rendering files Caused by error in `processx::run()`: ! System command 'quarto.exe' failed --- failed re-building 'spinebil.qmd' SUMMARY: processing the following files failed: 'ppi_diagnostics.qmd' 'spinebil.qmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted * checking PDF version of manual ... [20s] OK * checking HTML version of manual ... [6s] OK * DONE Status: 2 ERRORs