chrpos	seqnames	start	A	C	G	T	N	X.	X..1	X..2	A_plus	C_plus	G_plus	T_plus	N_plus	X._plus	X._plus.1	X._plus.2	A_minus	C_minus	G_minus	T_minus	N_minus	X._minus	X._minus.1	X._minus.2	A_SB	C_SB	G_SB	T_SB	N_SB	X._SB	X._SB.1	X._SB.2	cov	maj	fmaj	bruitdefond	MA	longdel	deletion_plus	deletion_minus	longdel_SB	contig	longins	insertion_plus	insertion_minus	longins_SB	longINDEL	N0	E0	p.sain	up.sain	E0indel	indel.p.sain	indel.up.sain	hotspot	probSNV	probINDEL	type	hprob	SBsnv	SBindel	SBref	SBscoreSNV	hSB	SBscoreINDEL	Baseref	Basemut	Freq	outlier
chr7:55259515	chr7	55259515	0	2	212	2556	0	0	3	9	0	2	119	1308	0	0	1	2	0	0	93	1248	0	0	2	7	NA	1	0.561320754716981	0.511737089201878	NA	NA	0.333333333333333	0.222222222222222	2770	2556	0.922743682310469	0.0772563176895307	212	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	192825	226	0.00117204719305069	0.00180311143736094	3	1.55581485803189e-05	0.000104697235132018	Hotspot	9.54271261888897e-277	0.0423091756014254	SNV	9.54271261888897e-277	0.561320754716981	NA	0.511737089201878	0.912496899177222	0.561320754716981	NA	T	G	0.0765342960288809	outlier
chr7:55259522	chr7	55259522	2792	0	7	0	0	0	0	4	1426	0	2	0	0	0	0	4	1366	0	5	0	0	0	0	0	0.510744985673352	NA	0.285714285714286	NA	NA	NA	NA	1	2799	2792	0.997499106823866	0.00250089317613433	7	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	192927	239	0.00123881053455452	0.0028763397856343	16	8.29329228153654e-05	0.000221950224398205	Non-hotspot	0.0263717357017253	0.205828662868339	SNV	0.0263717357017253	0.285714285714286	NA	0.510744985673352	1.96957350670011	0.285714285714286	NA	A	G	0.00250089317613433	no
chr7:55259546	chr7	55259546	2786	0	9	0	0	0	0	6	1404	0	3	0	0	0	0	6	1382	0	6	0	0	0	0	0	0.503948312993539	NA	0.333333333333333	NA	NA	NA	NA	1	2795	2786	0.996779964221825	0.00322003577817531	9	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	196335	285	0.00145160058064023	0.00344610421465015	6	3.05600122240049e-05	0.000105105077857354	Non-hotspot	0.00936390555709289	0.0813942516028567	SNV	0.00936390555709289	0.333333333333333	NA	0.503948312993539	1.60319979625927	0.333333333333333	NA	A	G	0.00322003577817531	no
chr7:55259557	chr7	55259557	2797	0	8	0	0	0	5	0	1417	0	2	0	0	0	0	0	1380	0	6	0	0	0	5	0	0.506614229531641	NA	0.25	NA	NA	NA	0	NA	2805	2797	0.997147950089127	0.0028520499108734	8	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	194097	225	0.00115921420732932	0.00189257414291918	3	1.54561894310577e-05	0.000103806228373702	Non-hotspot	0.00668810965479075	0.0425558572011359	SNV	0.00668810965479075	0.25	NA	0.506614229531641	2.29741764512762	0.25	NA	A	G	0.00285204991087344	no
chr7:55259593	chr7	55259593	2639	1	9	1	0	0	0	16	1231	1	5	0	0	0	0	16	1408	0	4	1	0	0	0	0	0.466464569912846	1	0.555555555555556	0	NA	NA	NA	1	2650	2639	0.995849056603774	0.00415094339622646	9	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	172013	334	0.00194171370768488	0.00415537799293111	6	3.48810845691895e-05	0.000397424642650468	Non-hotspot	0.0384626821613051	0.0877327691885363	SNV	0.0384626821613051	0.555555555555556	NA	0.466464569912846	0.844529434700154	0.555555555555556	NA	A	G	0.00339622641509434	no
chr7:55259595	chr7	55259595	0	2659	0	8	0	0	0	4	0	1250	0	4	0	0	0	3	0	1409	0	4	0	0	0	1	NA	0.470101541933058	NA	0.5	NA	NA	NA	0.75	2667	2659	0.997000374953131	0.00299962504686913	8	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	173720	171	0.000984342620308542	0.00260572492132621	3	1.72691687773429e-05	7.13437512859679e-05	Non-hotspot	0.00174405813051504	0.0451292784858985	SNV	0.00174405813051504	0.5	NA	0.470101541933058	0.58056187179374	0.5	NA	C	T	0.00299962504686914	no
chr7:55259600	chr7	55259600	0	7	0	2672	0	0	1	10	0	5	0	1261	0	0	0	9	0	2	0	1411	0	0	1	1	NA	0.714285714285714	NA	0.471931137724551	NA	NA	0	0.9	2679	2672	0.997387084733109	0.00261291526689067	7	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	170947	166	0.000971061206104816	0.00210224150009074	5	2.92488315091812e-05	8.88864282830551e-05	Non-hotspot	0.00573428539917292	0.0749564212932733	SNV	0.00573428539917292	0.714285714285714	NA	0.471931137724551	1.95284123572766	0.714285714285714	NA	T	C	0.00261291526689063	no
chr7:55259606	chr7	55259606	0	2658	0	4	0	0	0	3	0	1245	0	1	0	0	0	3	0	1413	0	3	0	0	0	0	NA	0.468397291196388	NA	0.25	NA	NA	NA	1	2662	2658	0.998497370398197	0.00150262960180314	4	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	167218	46	0.000275090002272483	0.00065663963534475	3	1.79406523221184e-05	6.53163350395146e-05	Non-hotspot	0.00110636741231924	0.0467446544785878	SNV	0.00110636741231924	0.25	NA	0.468397291196388	2.07782759848744	0.25	NA	C	T	0.00150262960180316	no
chr7:55259516	chr7	55259516	0	0	2767	1	0	0	2	0	0	0	1428	1	0	0	1	0	0	0	1339	0	0	0	1	0	NA	NA	0.516082399710878	1	NA	NA	0.5	NA	2768	2767	0.999638728323699	0.000361271676300623	1	0	NA	NA	NA	NA	0	NA	NA	NA	0	192074	106	0.000551870633193457	0.00183533869883985	0	0	0	Non-hotspot	0.450170212544693	0.000290938737148248	deletion	0.000290938737148248	1	NA	0.516082399710878	NA	NA	NA	DEL	T	0	no
